第三十八条违反本条例第十七条第八项、第二十一条第一款第三项规定，设置化工原料、矿物油类及有毒有害矿产品的贮存场所，以及生活垃圾、工业固体废物和危险废物的堆放场所和转运站的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门责令停止违法行为，限期采取治理措施，消除污染，处以二万元以上二十万元以下的罚款。
　　违反本条例第十七条第十项规定，进行可能严重影响饮用水水源水质的矿产勘查、开采等活动的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门会同有关部门责令停止违法行为，依法没收违法所得并处以一万元以上十万元以下的罚款。
　　第三十九条违反本条例第十八条第二项规定，从事经营性取土和采石（砂）等活动的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门会同有关部门责令停止违法行为，依法没收违法所得并处以一万元以上十万元以下的罚款。
　　违反本条例第十八条第四项规定，使用农药和化肥的，由县级以上地方人民政府农业、林业行政主管部门责令改正；情节严重的，处以五千元以上二万元以下的罚款。
　　违反本条例第十八条第五项、第六项、第二十二条第三项、第四项规定，修建墓地或者丢弃及掩埋动物尸体的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门责令改正处以五千元以上二万元以下的罚款。
　　违反本条例第十八条第八项规定造成污染的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门责令限期整改，处以一万元以上十万元以下的罚款。
　　第四十条违反本条例第十九条第二项规定，使用农药和化肥的，由县级以上地方人民政府农业、林业行政主管部门责令改正，处以一万元以上五万元以下的罚款。
　　违反本条例第十九条第四项规定，与保护水源无关的船舶停靠、装卸的，由县级以上地方人民政府海事管理机构责令驶离，可处以二万元以上二十万元以下的罚款。
　　违反本条例第十九条第五项规定，在水体清洗机动车辆的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门责令停止违法行为，处以二万元以上二十万元以下的罚款。
　　第四十一条违反本条例第二十一条第一款第二项规定，利用透水层孔隙、裂隙、溶洞和废弃矿坑储存油类、放射性物质、有毒有害化工物品、农药等的，由县级以上地方人民政府环境保护行政主管部门责令停止违法行为，限期采取治理措施，消除污染，可处以二万元以上二十万元以下的罚款。